自首屆至第九屆整整廿六年之間竟無固定會址,每屆均寄籬於各屆理事長宅辦公並隨之遷移。對於會務之推動與聯繫上深感不便。遂於第九屆購置現址會館,民國六十五年三月落成啟用,從此本會即擁有自己會館為本會發展史添上新里程碑。
本會第二十一屆第一次會員代表大會通過向法院申請社團法人登記案,遂於98年7月2日完成臺灣雲林地方法院設立登記,並於同年7月10日經主管機關准予正式更名為「社團法人雲林縣醫師公會」。
93.5.23第19屆第2次會員代表大會修改通過
99.5.16第21屆第2次會員代表大會修改通過
100.4.24第21屆第3次會員代表大會修改通過
100.8.28第21屆第1次臨時會員代表大會修改通過
105.4.17第23屆第2次會員代表大會修改通過
106.4.16第23屆第3次會員代表大會修改通過
108.5.5第24屆第2次會員代表大會修改通過
111.5.15第25屆第2次會員代表大會修改通過
113.4.28第26屆第1次會員代表大會修改通過第十五條之一